基因體學資料科學專業課程

Contents

成為下一代定序( sequencing )資料科學家。掌握定序資料革命尖端的工具和技術。

關於此專業課程

隨著基因體學引發醫學發現的一場革命，必須更好地瞭解基因體，並能夠利用基因體資料集中的資料和資訊。基因體資料科學是將統計和資料科學應用於基因體的領域。

本專業涵蓋了用於理解、分析和解釋來自下一代定序實驗的資料的概念和工具。它講授了基因體資料科學( genomic data science )中最常用的工具，包括如何使用命令列以及各種軟體實踐工具，例如 Python、R、Bioconductor 和 Galaxy。

該專業旨在既可作為基因體資料科學的獨立導論，也可作為生物學、分子生物學或遺傳學的一級學位或博士後的完美補充，以供這些領域的科學家尋求對資料科學和統計工具的熟悉度在日常工作中更好地與資料進行互動。

英文

約翰霍普金斯大學的任務是教育學生，培養他們的終身學習能力，促進獨立和原創的研究，並將發現的益處帶給世界。

本課程向你介紹現代基因體學的基本生物學以及我們用來測量它的實驗工具。我們將介紹分子生物學的中心教條，並介紹如何將下一代定序用於測量DNA、RNA 和表觀遺傳模式。你還將獲得計算和資料科學中的關鍵概念簡介，你將需要了解如何生成和分析來自下一代定序實驗的數據。

這是基因體資料科學專業的第一門課程。

了解如何使用 Galaxy 專案中可用工具。這是基因體資料科學專業的第二門課程。

此類提供對 Python 程式語言和i Python 筆記本的介紹。這是約翰·霍普金斯大學基因體資料科學專業的第三門課程。

我們將學習用於分析 DNA 定序資料的計算方法 – 演算法和資料結構。我們將學習一些有關 DNA、基因體學以及如何使用 DNA 定序的知識。我們將使用 Python 來實現關鍵演算法和資料結構，並分析實際的基因體和 DNA 定序資料集。

介紹管理和分析目錄、檔案以及大量基因組數據所需的命令。這是約翰·霍普金斯大學基因體資料科學專業的第四門課程。

學習使用 Bioconductor 專案中的工具來進行基因體資料分析。這是約翰·霍普金斯大學基因組大資料專業的第五門課程。

介紹最流行的基因體資料科學專案背後的統計資訊。這是約翰·霍普金斯大學基因組大資料科學專業的第六門課程。

在這個最終的專案中，你將運用前面所有專業課程所學到的工具和技術。你將使用真實的數據集來執行分析並準備發現結果的報告。